Náš imunitní systém funguje podle základního předpokladu, že "já" se liší od "ne-já." Jeho primární funkcí spočívá v rozlišování mezi těmito subjekty, přičemž bývalý sám, když útočí na druhé. Přesto dnes víme, že naše vnitřnosti jsou domovem populace bakteriálních buněk tak rozsáhlý, že oni outnumber naše vlastní buňky, a že tyto mikroflóry jsou zásadní pro naše vlastní přežití.
Jako nedávné studie v časopise Nature uvádí imunologie, "rovnováha je usazen mezi mikroflóry a imunitního systému, který má zásadní význam pro střevní homeostázy." Jak funguje imunitní systém dosáhnout rovnováhy, ani hraní v afektu a útočit na symbiotické bakterie, ani není laxní a umožňuje patogenů projít? Ukazuje se, že naše střevní bakterie manipulují imunitní systém, aby věci z začíná vymykat z rukou.